日本館のシンボルマーク“笑顔のつながり”（中文訳：微笑相联／英文訳：Smile to Smile）は、日本館のメッセージのキーワードである「つながり」、特に「こころのつながり」を大切にする気持ちを表現しています。大人も子供も見るだけでやさしい気持ちになれる曲線が描くのは、笑顔のつながりです。そして色合いは、日本と中国の友好のシンボルとして日本館の展示に登場する朱鷺（トキ）の色でもあります。

シンボルマークは、若手デザイナーを対象とした指名コンペ方式でデザインコンペを実施し、6名のデザイナーによる23作品から選ばれました。